Pri novi ali rekonstruirani mali komunalni čistilni napravi mora investitor zagotoviti prve meritve KPK in BPK5. Prve meritve se izvedejo na način, določen s predpisi o prvih meritvah odpadnih vod.
Prvih meritev se ne izvaja za malo komunalno čistilno napravo (AQUAmax), za katero je izdana listina o skladnosti komunalne čistilne naprave o tipskem preizkušanju, če iz same listine o skladnosti ali iz standarda, na katerega se nanaša listina o skladnosti, izhaja, da vrednosti parametrov KPK in BPK5 ne presegajo mejnih zakonsko določenih vrednosti.
Prvih meritev emisije snovi se obenem ne izvaja pri odvajanju odpadne vode iz male komunalne čistilne naprave (AQUAmax), katere zmogljivost je manjša od 50 PE, če je zgrajena ali kot gradbeni proizvod izdelana kot mala komunalna čistilna naprava v skladu s standardi od SIST EN 12566–1 do SIST EN 12566–5.
Pomembno je, da ima mala komunalna čistilna naprava, ki je gradbeni proizvod, opravljen tipski preskus pri priglašenem evropskem organu (npr. PIA), proizvod mora biti skladen tudi s trenutno veljavnimi direktivami o strojih LVD in EMC.
Za malo biološko čistilno napravo, katere zmogljivost je enaka ali manjša od 50 PE, se lahko namesto meritev (obratovalnega monitoringa) izdela ocena obratovanja naprave, iz katere mora biti razvidno, da učinek čiščenja male komunalne čistilne naprave zagotavlja izpolnjevanje zakonskih zahtev.
Oceno obratovanja male komunalne čistilne naprave izdela izvajalec javne službe na obrazcu, ki ga objavi ministrstvo na svojih spletnih straneh. Izdela jo za vsako malo komunalno čistilno napravo na območju lokalne skupnosti, kjer izvaja javno službo, ne glede na to, ali malo komunalno čistilno napravo upravlja sam v okviru izvajanja storitev javne službe ali druga oseba.
Izvajalec javne službe (komunala) mora ministrstvu, pristojnemu za okolje, najkasneje do 31.marca posredovati poročila o obratovalnih monitoringih za preteklo leto ter posredovati podatke o meritvah na vseh malih komunalnih čistilnih napravah, za katere mora izvajati obratovalni monitoring.